中国农业科学院蜜蜂所研究人员构建出东方蜜蜂的泛基因组序列
2023-12-12 16:02:48来源: 中国农业科学院蜜蜂研究所
近日，中国农业科学院蜜蜂研究所联合首都师范大学等单位，构建了首个东方蜜蜂的泛基因组序列，并揭示了结构变异在东方蜜蜂演化与环境适应性方面的作用。相关研究成果发表在《分子生态资源（Molecular Ecology Resources）》上。
东方蜜蜂是一种具有重要生态与经济价值的传粉昆虫，对其遗传变异进行解析有助于理解其种群动态、演化规律以及环境适应能力。然而，迄今为止的研究局限于使用单一的参考基因组序列来研究小尺度的遗传变异，忽略了大尺度的基因组变异。
本研究采用三代测序技术为东方蜜蜂的祖先群体创制了染色体水平的参考基因组序列，结合525个基因组重测序数据，构建出东方蜜蜂的首个泛基因组序列。研究发现，超过30%的东方蜜蜂的基因在不同群体间存在变异，这些可变基因很可能为蜜蜂适应不同的环境条件提供了丰富的基因库。本研究进一步发现，大尺度的结构变异是独立于小尺度的点突变之外的遗传变异类型。通过关联分析发现，有44个结构变异与环境因子高度连锁，实验表明其中一个结构变异很可能通过降低临近基因的表达来促进我国阿坝地区的东方蜜蜂适应当地的寒冷环境。本研究不仅丰富了东方蜜蜂的基因组学资源，而且为将来的种质资源保护与遗传改良提供有价值的基因信息。
该研究得到国家自然科学基金与中国农业科学院基本科研业务费的资助。
原文链接：https://doi.org/10.1111/1755-0998.13905
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